Актуальность создания Академии «Высшая инженерная школа» обусловлена технологическими изменениями в транспортной сфере. Деятельность Инженерной школы направлена на содействие в достижение целей реализации Указа Президента Российской Федерации от 7 мая 2018 г. № 204 «О национальных целях и стратегических задачах развития Российской Федерации на период до 2024 года», Транспортной стратегии Российской Федерации на период до 2030 года, Программы «Цифровая экономика Российской Федерации». На базе новой, высокотехнологичной инфраструктуры ВИШ готовит «инженеров развития» транспортной отрасли. Отличительная особенность образовательного процесса в Академии — «перевернутый» учебный план.

Это означает, что с самого начала обучения студентам даются базовые знания и навыки по выбранной специальности, а затем происходит изучение общих, развивающих дисциплин. Такой подход позволяет в полной мере реализовать еще один важный принцип ВИШ — интеграция проектной деятельности в образовательный процесс. В рамках такого формата проектно-ориентированной подготовки кадров, студенты решают реальные задачи и кейсы от компаний-партнеров: Метрополитена, Дептранса Москвы, РЖД, МаксимаТелеком и многих других. Также студенты имеют возможность прорабатывать свои проекты и консультироваться с сотрудниками научно-образовательных и исследовательских центров, входящих в пул R&D-центров Академии.
В 2022 году была запущена совместная бакалаврская программа с Высшей школой экономики.